Podle nařízení vlády číslo 244/2016 Sb, dochází ve vykazování Intastatu k některým změnám. Velmi důležitou změnou je zvýšení limitu, resp. prahu pro status zpravodajské jednotky, jinými slovy pro počátek povinnosti vykazovat Intrastat. Původní výše 8 mil. korun souhrnu dovozu a vývozu v rámci EU se v roce 2019 zvyšuje na 12 mil korun. Znamená to tedy, že subjekty, které limitu 12-ti mil. korun v kalendářním roce 2019 nedosáhnou, nebudou již nuceni Intrastat vykazovat. Také ostatní členské státy EU změnily limit pro Intrastat, jako například Finsko, Dánsko, Rumunsko nebo Bulharsko. Některé státy ponechávají limit na stejné úrovni- Litva, Estonsko, Švédsko.

Další změna se týká případů, kdy je zboží na omezenou dobu odesláno nebo přijato za účelem pronájmu bez změny vlastníka na dobu kratší než dva roky. Je-li předmětné z boží následně zakoupeno nebo prodáno, stane se předmětem výkazu Intrastat, a to ke dni změny vlastnického práva.

Od roku 2020 se také při vykazování Intrastatu počítá s přidáním povinných údajů. Jedná se například o čísla DIČ a deklarovaný původ zboží. Země jako jsou Belgie, Německo, Irsko nebo Portugalsko již tyto změny zakomponovaly do svých národních předpisů.

Celkově můžeme sledovat tendence o co nejvyšší harmonizaci a sdílení dat mezi statistickými, finančními a celními úřady. Zaznamenáváme vyšší četnost kontrol, dotazů a šetření za účelem ověřování řádného vykazování a správnosti poskytovaných dat.